Conforme estimativa do Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística (IBGE) de 2025, sua população era de 504 166 habitantes, ficando na 10.ª posição entre os municípios mais populosos do estado e no 48.º lugar no Brasil. No censo de 2022 do IBGE a cidade tinha 480 383 habitantes e uma densidade populacional de 1 112,17 pessoas/km². Também é a sede e mais populosa das 36 cidades que compõem a Região Imediata de São José do Rio Preto que, por sua vez, é uma das seis regiões imediatas que integram a Região Intermediária de São José do Rio Preto. Sua região metropolitana, que conta com 37 municípios e foi criada pela Lei Complementar nº 1.359, de 24 de agosto 2021, tem uma população de 1.010.633 habitantes e é a 30ª maior do Brasil.
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